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    超速行駛的基因編輯,終于有了“剎車”裝置

    原標(biāo)題:超速行駛的基因編輯,終于有了“剎車”裝置

    基因編輯技術(shù),想必大伙都不陌生啦。

    去年沸沸揚(yáng)揚(yáng)的賀建奎“改造雙胞胎女嬰”事件,譴責(zé)聲言猶在耳。不過,沒有什么能夠阻擋,人類對(duì)“上帝之手”的向往。事實(shí)上,高光過后的基因編輯技術(shù),還在以激進(jìn)的方式進(jìn)行著。

    前不久美國媒體就披露了程序員 Bryan Bishop的創(chuàng)業(yè)項(xiàng)目,他打算創(chuàng)辦一家專門生產(chǎn)設(shè)計(jì)嬰兒的公司,打造“完美嬰兒”,并且已經(jīng)擁有了第一對(duì)客戶。

    據(jù)說,這些嬰兒“不用健身就能增長肌肉”,一出生就自帶“長命百歲”buff。不過,這并不代表它們就一定會(huì)成為贏在胚胎起跑線上的“人生贏家”,因?yàn)榛蚓庉嫾夹g(shù)目前依然存在不良免疫反應(yīng)、“馬賽克效應(yīng)”等問題,也就是說,這些孩子長大后到底什么樣,沒人知道答案。

    比起超級(jí)人工智能,基因編輯可說是“開弓沒有回頭箭”。畢竟機(jī)器的“拔電權(quán)”還掌握在人類手中,那些被基因改造過的動(dòng)物或者人類,總不能說“拔電”就“拔電”吧。

    就在上周,《細(xì)胞》雜志刊登了一篇文章,來自哈佛醫(yī)學(xué)院的研究者宣布發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)新的分子,能夠識(shí)別并綁住 DNA,在幾分鐘內(nèi)就停下基因編輯的傳播。

    與其盲目擔(dān)憂,不如來聊一聊,到底哪些技術(shù)才能真正給基因編輯裝上“剎車”?

    爭議不斷的基因編輯技術(shù),是怎樣踩上“油門”的?

    網(wǎng)絡(luò)時(shí)代大家的記憶力常??氨冉痿~,所以在了解基因編輯的逆轉(zhuǎn)方法之前,我們先來簡單快速幫助大家回憶一下,號(hào)稱“基因剪刀手”的CRISPR技術(shù),究竟是怎樣踩上了爆發(fā)的“油門”?

    CRISPR的全稱是Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats,即一系列重復(fù)的DNA序列,細(xì)菌能夠利用這些基因序列“記住”攻擊它們的每種病毒,當(dāng)同種病毒再次發(fā)起攻擊時(shí),就能夠給予生物體一定的保護(hù)或免疫力。

    因此,使用CRISPR對(duì)相關(guān)DNA進(jìn)行切割和編輯 ,理論上來說能夠?qū)ζ鸬降钟《炯百|(zhì)粒入侵的作用。

    但是,針對(duì)單個(gè)基因的編輯行為,會(huì)不會(huì)導(dǎo)致其他地方發(fā)生意外,出現(xiàn)組織異常生長、引發(fā)癌癥等問題,至今仍然是個(gè)謎。尤其是使用CRISPR進(jìn)行人體治療時(shí),很難精確地知道其可能帶來的影響范圍,有的細(xì)胞可能會(huì)被修復(fù),而有些則不會(huì),這種“馬賽克”效應(yīng)充滿了未知。比如說,免疫系統(tǒng)可以在達(dá)到目的之前處理掉Cas酶(一種能夠促使Cascade干預(yù)病毒增殖的解旋酶),可能導(dǎo)致炎癥等不良反應(yīng)。1999年,就有一位患者在死于嚴(yán)重的免疫反應(yīng)。

    (基因編輯技術(shù)的基本原理)

    這樣一個(gè)應(yīng)該被謹(jǐn)慎對(duì)待的技術(shù),為何突然踩上“油門”,從實(shí)驗(yàn)室走到了醫(yī)院、社區(qū)甚至一些狂熱愛好者的案頭呢?

    有幾個(gè)主要原因:

    一是基因編輯在治療領(lǐng)域、生物實(shí)驗(yàn)上的成功應(yīng)用,使其潛力快速得到了大眾追捧。NHS信托倫敦大奧蒙德街兒童醫(yī)院就利用基因編輯技術(shù)TALEN,成功治愈了一歲小女孩Layla的白血病。前不久,有科學(xué)家將人類大腦中發(fā)育的基因MCPH1植入11只恒河猴的腦中,證明基因改造過的猴子短期記憶和反應(yīng)能力都更好。能阻止遺傳學(xué)疾病的傳遞,這一愿景讓完全禁止基因編輯并不現(xiàn)實(shí)。

    二是技術(shù)的易得性。如此強(qiáng)大的技術(shù),其應(yīng)用門檻卻越來越低。以普及程度最高的Crispr-Cas9為例,在切割的同時(shí)還可以將新的DNA序列嵌入進(jìn)去,實(shí)現(xiàn)“增強(qiáng)”的目的,如今已經(jīng)進(jìn)入市場應(yīng)用的最后階段,設(shè)備價(jià)格越來越便宜,掌握這項(xiàng)技術(shù)專業(yè)知識(shí)的人也越來越多,不僅醫(yī)院能搞,民科、技術(shù)宅也能上。

    生物黑客初創(chuàng)公司Odin就在其網(wǎng)站上銷售DIY Bacterial CRISPR試劑盒,只需159美元,就能將增強(qiáng)基因帶回家……2017年10月,Odin的首席執(zhí)行官Josiah Zayner就在合成生物學(xué)會(huì)議上為自己注入了CRISPR改造肌肉生長的基因。

    第三個(gè)則是來自社會(huì)整體層面的有意放縱。

    其中最有代表性的,就是私人對(duì)人體增強(qiáng)的過度追求。

    隨著技術(shù)生態(tài)的完善,針對(duì)胚胎的基因編輯已經(jīng)很難獲得政府的資助和支持,都是依靠私人贊助完成。

    例如2017年8月,俄勒岡州健康和科學(xué)大學(xué)的生殖生物學(xué)家Shoukhrat Mitalipov所領(lǐng)導(dǎo)的研究小組就獲得了私人贊助,使用CRISPR-Cas9識(shí)別了導(dǎo)致心肌增厚的胚胎突變。經(jīng)過技術(shù)校正,突變的胚胎在實(shí)驗(yàn)室將突變率恢復(fù)到了72%(高于普通50%的遺傳率)。

    而一些沉迷與“基因魔剪”的科學(xué)家,也總在技術(shù)紅線的邊緣瘋狂試探,過度鼓吹基因編輯的價(jià)值。有的科學(xué)家相信CRISPR可以復(fù)生滅絕物種,來自哈佛大學(xué)遺傳學(xué)家喬治·徹奇(George Church)就宣布要培育出大象-猛犸象雜交胚胎,復(fù)生長毛猛犸象來控制全球變暖。愿望固然是美好的,但誰又能保證不會(huì)創(chuàng)造出現(xiàn)實(shí)版的“侏羅紀(jì)公園”呢?

    另一方面,基因編輯也成為國家之間科技競爭的主要標(biāo)的。比如美國國防部的高級(jí)研究計(jì)劃局(DARPA)已經(jīng)在為新基因編輯制造的新一代生物武器做準(zhǔn)備,并正在開發(fā)解毒劑,歐洲也希望在CRISPR的疾病應(yīng)用上保持優(yōu)勢(shì),已經(jīng)計(jì)劃開展其首個(gè) CRISPR 臨床試驗(yàn)。中國也在這項(xiàng)技術(shù)上占據(jù)了領(lǐng)先地位,尤其是在使用 CRISPR技術(shù)編輯胚胎上,人體首例基因編輯(基于 CRISPR)的臨床試驗(yàn)就是由中國科學(xué)家團(tuán)隊(duì)完成的。

    在這樣的大背景下,想要全面禁止基因編輯根本不可能。

    給基因編輯裝“剎車”,都有哪些好辦法?

    基因編輯一旦開始就無法中斷,只能等待整個(gè)改造過程自然結(jié)束,會(huì)給個(gè)體及其后代帶來永久性的基因改變,這就好像一輛高速行駛的汽車卻沒有剎車一樣。

    因此,對(duì)于“有目的制造或修飾人類胚胎以改變遺傳基因的臨床試驗(yàn)”,社會(huì)和學(xué)界的譴責(zé)從來就沒有停止過:既然沒有剎車,咱們能盡量不飆車嗎?上路前,咱們能先登個(gè)記嗎?

    今年3月,頂級(jí)學(xué)術(shù)刊物《自然》就發(fā)表了一篇由來自7個(gè)國家的18名科學(xué)家和生物倫理學(xué)家共同署名的文章,呼吁全球“暫?!比祟惿臣?xì)胞系基因組編輯的臨床使用。世界衛(wèi)生組織也計(jì)劃建立一套全球登記系統(tǒng)來記錄所有與人類基因組編輯有關(guān)的實(shí)驗(yàn)。

    結(jié)果大家也看到了——然并卵。

    因此,也有一部分科學(xué)家一直試圖通過技術(shù)來給基因編輯裝上“剎車”。

    基因治療法 CRISPR-Cas9 的聯(lián)合發(fā)明人詹妮弗·杜德納就是其中之一。她曾在著作《A Crack in Creation》(創(chuàng)造的裂縫)一書中提到:“在災(zāi)難發(fā)生之前,關(guān)心這個(gè)問題的科學(xué)家能否阻止它發(fā)生?”

    (CRSIPR-Cas9 的發(fā)現(xiàn)者之一Jennifer Doudna)

    目前,這項(xiàng)工作已經(jīng)小有成果,能夠?qū)蚓庉嬈鸬郊s束作用的方法主要有三種:

    一種是讓被編輯的基因“自我毀滅”。

    麻省理工學(xué)院的研究人員開發(fā)了一種可以讓細(xì)菌自我毀滅的“自殺片段”。細(xì)菌植入這種基因片段之后,不得不依賴實(shí)驗(yàn)室中培育細(xì)菌的環(huán)境生存。一旦離開了實(shí)驗(yàn)室,自殺基因片段就會(huì)被誘發(fā),從而刪除細(xì)菌內(nèi)特定的基因,讓其快速死亡。

    研究人員為大腸桿菌植入了一種名為 DNAi 的系統(tǒng)。系統(tǒng)由兩個(gè)部分組成,一個(gè)是通經(jīng)過CRISPR 技術(shù)編輯、可以準(zhǔn)確定位細(xì)菌核心基因的片段,另一個(gè)則是會(huì)被阿拉伯糖分子誘發(fā)、能夠切除核心基因的 Cas9 酶。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,大腸桿菌接觸阿拉伯糖分子后 15 分鐘的時(shí)間內(nèi),99%的細(xì)菌都被殺死了。

    在一些針對(duì)果蠅、蚊子等開展的基因工程上,能夠有效防范其被轉(zhuǎn)化為群體性攻擊的生物武器,讓離開實(shí)驗(yàn)室的細(xì)菌快速死亡。同時(shí)也可以保護(hù)一些機(jī)密研究成果不被泄露。

    第二種方法則比較溫和,就是通過反CRISPR分子(anti-CRISPRs)來終止基因編輯過程。

    該分子最早是被多倫多大學(xué)的一名學(xué)生發(fā)現(xiàn)的,他在研究中發(fā)現(xiàn)一些特定的噬菌體對(duì) CRISPR有抵抗作用,相當(dāng)于把Cas9的手腳捆住,讓它沒有辦法來殺滅目標(biāo)DNA,從而終止基因編輯過程。

    從2013年至今,已經(jīng)有超過40個(gè)反CRISPR分子被發(fā)現(xiàn)。前不久《CELL》公布了該領(lǐng)域的最新研究成果,哈佛醫(yī)學(xué)院的研究者Amit Choudhary剛剛發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)新的分子,能夠識(shí)別并綁住DNA,可以在幾分鐘內(nèi)就停止基因編輯。

    這兩個(gè)分子比之前發(fā)現(xiàn)的反CRISPR分子都小,因此能夠在引發(fā)免疫反應(yīng)之前更快生效,更好地達(dá)到“剎車”的作用。

    另一方面,這些ACR分子也能夠起到精準(zhǔn)控制的作用讓基因編輯變得更精確,副作用也更少。布羅德研究所的生物科學(xué)家Dane Hazelbaker形容反CRISPR分子——它就像“能在手術(shù)剪刀剪向重要器官之前,狠狠拽開拿著剪刀的雙手?!?/p>

    另一種方法屬于未雨綢繆型,就是利用智能技術(shù)與超級(jí)計(jì)算機(jī),對(duì)基因編輯進(jìn)行模擬,在實(shí)驗(yàn)開始前就預(yù)測和規(guī)避掉某些潛在問題。

    今年5月,北德克薩斯大學(xué)(UNT)的研究團(tuán)隊(duì)就使用德克薩斯高級(jí)計(jì)算中心(TACC)的Maverick超級(jí)計(jì)算機(jī),對(duì)Cas9催化的DNA裂解進(jìn)行了首次全原子分子動(dòng)力學(xué)模擬。

    除了觀察Cas9復(fù)合物如何變?yōu)榛钴S狀態(tài)之外,模擬行為還精準(zhǔn)地揭示了它剪斷DNA的位置與過程,確定了其工作原理。

    這項(xiàng)工作可以幫助基因編輯可以以更可控的方式切割DNA,也能解決Cas9產(chǎn)生鈍端或交錯(cuò)結(jié)束的斷裂等問題。

    相比起研究基因編輯(主要是CRISPR)的團(tuán)隊(duì),研究如何停止、逆轉(zhuǎn)基因編輯過程的科研力量要小得多,整個(gè)研究也處于相對(duì)早期的階段。

    但至少在全社會(huì)都試圖危險(xiǎn)飆車的時(shí)候,為技術(shù)裝上安全帶和剎車裝置,試圖創(chuàng)造一個(gè)能夠與技術(shù)迭代速度相匹配的約束體系,或許更值得關(guān)注和投入。

    科幻電影中,基因改造的變異生物逃出實(shí)驗(yàn)室,總能引發(fā)人們對(duì)技術(shù)的負(fù)面猜想與憂慮。這或許就是技術(shù)的意義所在:它一邊誘惑著人對(duì)不朽的渴望,一邊威脅著毀滅世界。

    極客網(wǎng)企業(yè)會(huì)員

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    2019-05-11
    超速行駛的基因編輯,終于有了“剎車”裝置
    生物黑客初創(chuàng)公司Odin就在其網(wǎng)站上銷售DIY Bacterial CRISPR試劑盒,只需159美元,就能將增強(qiáng)基因帶回家……2017年10月,Odin的首席執(zhí)行官Josiah Zayner就在合成

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