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    NEC發(fā)布基于AI的新型冠狀病毒疫苗設(shè)計基因分析結(jié)果

    NEC日前發(fā)布了采用AI預(yù)測技術(shù)的基因分析結(jié)果,用于設(shè)計可促進(jìn)全球多數(shù)人群T細(xì)胞反應(yīng)(注1)的SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)疫苗。本成果旨在幫助防止新型冠狀病毒感染癥“COVID-19”感染擴(kuò)大,并支援全球疫苗開發(fā),由NECOncoImmunityAS(注2)與NEC歐洲研究所合作成立的研究團(tuán)隊所取得。本研究應(yīng)用了NEC與NECOncoImmunity在個體化癌癥疫苗開發(fā)中使用的AI預(yù)測技術(shù)。

    論文網(wǎng)站“bioRxiv”上發(fā)表的研究結(jié)果顯示,分析數(shù)千種SARS-CoV-2的基因組序列,鎖定了全球人群中最經(jīng)常被找到的100個HLA等位基因(多種免疫型)的表位(可作為疫苗靶點(diǎn))。

    具體來說,不僅使用預(yù)測算法分析了作為冠狀病毒名稱起源的表面刺突蛋白,還分析了SARS-CoV-2的全部蛋白,根據(jù)所得數(shù)據(jù),對多個HLA等位基因型鎖定“熱點(diǎn)(HotSpot)”,該“熱點(diǎn)”重復(fù)包含了SARS-CoV-2蛋白中的共通表位。另外,充分采用本算法,優(yōu)先選定了全球人群覆蓋最廣、且病毒蛋白中變異較少、今后也很難發(fā)生變異的保存區(qū)域中獲得的最佳熱點(diǎn)組。并且,為確保安全性,除去了病毒表位中與人類蛋白相似度高、特別是在重要臟器中發(fā)現(xiàn)的熱點(diǎn)。

    本成果的分析結(jié)果展示了對世界多數(shù)人群安全有效、且亦能應(yīng)對現(xiàn)在和將來的病毒多樣性的疫苗設(shè)計,同時也體現(xiàn)了NEC集團(tuán)AI預(yù)測技術(shù)的技術(shù)水平高度。

    在公開本次研究成果、支援科學(xué)進(jìn)步的同時,NEC將開啟以加快疫苗開發(fā)為目的的合作活動。

    NEC常務(wù)執(zhí)行董事兼首席技術(shù)官西原基夫表示:“很高興NEC的AI技術(shù)能夠為當(dāng)今世界面臨的嚴(yán)重問題做出貢獻(xiàn)。在世界各國都在為解決這一艱難課題而努力的情況下,NEC作為企業(yè)公民也有責(zé)任和義務(wù)參與到這一行動中。我們將以此次研究為開端,最大限度地活用AI技術(shù)這一NEC集團(tuán)的優(yōu)勢,與各種各樣的企業(yè)和機(jī)構(gòu)合作,抑制新型冠狀病毒感染癥的擴(kuò)大,為了讓全球的人們能夠盡早恢復(fù)日常生活而努力。”

    NEC OncoImmunity的首席科學(xué)家TrevorClancy博士表示:“敝公司首席執(zhí)行官RichardStratford博士和其團(tuán)隊以及NEC集團(tuán),對于我們針對個體化癌癥免疫療法的機(jī)器學(xué)習(xí)軟件&lsquo;NECImmuneProfiler&rsquo;從現(xiàn)在投入的癌癥領(lǐng)域迅速適應(yīng)感染癥領(lǐng)域,并能夠為新型冠狀病毒感染癥的應(yīng)對提供支持,感到非常振奮。我們的AI和生物信息平臺,不僅可以守護(hù)全球人類,而且對于現(xiàn)在和將來可能發(fā)生的新型冠狀病毒的多種變異版本,還能夠設(shè)計出可引發(fā)以長期記憶免疫反應(yīng)等廣泛免疫反應(yīng)的疫苗,這是一種很大的鼓勵?!?/p>

    NEC歐州研究所數(shù)據(jù)科學(xué)與系統(tǒng)平臺部門總經(jīng)理SaverioNiccolini博士表示:“我們原本是為預(yù)測各個癌癥患者的免疫反應(yīng)而設(shè)計的算法,應(yīng)用到了大規(guī)模的感染癥群體。我們算法中的計算機(jī)驗證(insilico驗證)考慮到了人類在整個大陸的遺傳背景。目前,全球正受到日益擴(kuò)大的新型冠狀病毒感染癥的威脅,我們的成果顯示了為阻止這一威脅的全球舉措做出貢獻(xiàn)的可能性,這是非常重要的。我們已開始與合作伙伴就wet-lab實(shí)驗進(jìn)行協(xié)商,正在為開發(fā)出對全球多數(shù)人群有效的疫苗而邁出重要的一步?!?/p>

    論文信息

    標(biāo)題:

    ArtificialintelligencepredictstheimmunogeniclandscapeofSARS-CoV-2:towarduniversalblueprintsforvaccinedesigns

    作者:

    BrandonMalone,BorisSimovski,Cl&eacute;mentMolin&eacute;,JunCheng,MariusGheorghe,HuguesFontenelle,

    IoannisVardaxis,SimenTenn&oslash;e,Jenny-AnnMalmberg,RichardStratford,TrevorClancy

    摘要URL:

    (注1)T細(xì)胞反應(yīng):T細(xì)胞是白血球中的一種免疫細(xì)胞,激活T細(xì)胞的反應(yīng)為T細(xì)胞反應(yīng)。

    (注2)總部:挪威奧斯陸、CEO:RichardStratford。

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    2020-04-29
    NEC發(fā)布基于AI的新型冠狀病毒疫苗設(shè)計基因分析結(jié)果
    NEC日前發(fā)布了采用AI預(yù)測技術(shù)的基因分析結(jié)果,用于設(shè)計可促進(jìn)全球多數(shù)人群T細(xì)胞反應(yīng)(注1)的SARS-CoV-2(新型冠狀病毒)疫苗。

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