據(jù)報(bào)道,Alphabet旗下人工智能公司DeepMind開(kāi)發(fā)了一款軟件,可以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)在幾天時(shí)間里會(huì)折疊成什么樣的結(jié)構(gòu),從而解決了過(guò)去50年的一項(xiàng)“重大挑戰(zhàn)”。這可能為更好地了解疾病和藥物研發(fā)鋪平道路。
每個(gè)活細(xì)胞體內(nèi)都有成千上萬(wàn)種不同的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)也是細(xì)胞生存的基礎(chǔ)。預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)如何折疊非常重要,因?yàn)檫@決定了蛋白質(zhì)的性質(zhì)。幾乎所有疾病,包括癌癥和老年癡呆癥,都與蛋白質(zhì)的功能有關(guān)。
歐洲生物信息學(xué)研究所的珍妮特·桑頓(Dame Janet Thornton)教授表示:“蛋白質(zhì)是最美麗的結(jié)構(gòu)。準(zhǔn)確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的折疊非常具有挑戰(zhàn)性,多年來(lái)一直困擾著很多人。”
DeepMind的AlphaFold人工智能系統(tǒng)參加了一項(xiàng)由“結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)關(guān)鍵評(píng)估”組織(CASP)舉辦的比賽。該組織的目標(biāo)是,圍繞如何計(jì)算蛋白質(zhì)分子三維結(jié)構(gòu)的問(wèn)題,更快地尋找解決方案。
CASP在過(guò)去25年中一直在關(guān)注這個(gè)領(lǐng)域的進(jìn)展,該組織的評(píng)價(jià)方式是將參賽者提供的解決方案與“黃金試驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)”進(jìn)行對(duì)比。本周一,該組織表示,DeepMind的AlphaFold系統(tǒng)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方面表現(xiàn)出了無(wú)與倫比的準(zhǔn)確性。
CASP主席約翰·墨爾特(John Moult)教授表示:“DeepMind已經(jīng)取得領(lǐng)先。計(jì)算機(jī)科學(xué)領(lǐng)域長(zhǎng)達(dá)50年的重大挑戰(zhàn)在很大程度上已得到解決。對(duì)于藥物設(shè)計(jì),以及蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)等新興領(lǐng)域,這都將產(chǎn)生重大影響。”
DeepMind大約有1000名員工,但幾乎沒(méi)有任何收入。谷歌母公司Alphabet為支持該公司投入了巨額成本。不過(guò),DeepMind已經(jīng)與Facebook人工智能實(shí)驗(yàn)室、微軟和OpenAI等實(shí)體一起,成為了全球人工智能競(jìng)賽的領(lǐng)先者之一。
谷歌CEO桑達(dá)爾·皮查伊(Sundar Pichai)在Twitter上為此次突破點(diǎn)贊。DeepMind聯(lián)合創(chuàng)始人及CEO德米斯·哈薩比斯(Demis Hassabis)則表示:“DeepMind背后的終極愿景一直是構(gòu)建通用人工智能,利用通用人工智能來(lái)極大地加速科學(xué)發(fā)現(xiàn)的步伐,幫助我們更好地了解周圍世界。”
谷歌2014年以6億美元的價(jià)格收購(gòu)了DeepMind。該公司以圍棋人工智能AlphaGo而聞名。不過(guò)該公司一直表示,希望能在科學(xué)領(lǐng)域發(fā)揮更大的影響力。
哈薩比斯說(shuō):“游戲是很好的試驗(yàn)平臺(tái),有助于高效地開(kāi)發(fā)和測(cè)試通用算法。但我們希望,未來(lái)某天這些算法能應(yīng)用到現(xiàn)實(shí)世界,例如去解決科學(xué)問(wèn)題。我們認(rèn)為,AlphaFold是證明這個(gè)邏輯的第一步。這些算法現(xiàn)在正變得足夠成熟和強(qiáng)大,能夠應(yīng)用于真正具有挑戰(zhàn)性的科學(xué)問(wèn)題。”
DeepMind早在2018年就參加了CASP蛋白質(zhì)折疊比賽,取得的結(jié)果相當(dāng)不錯(cuò)。但AlphaFold負(fù)責(zé)人約翰·姜普(John Jumper)當(dāng)時(shí)認(rèn)為,要想產(chǎn)出“真正具有生物學(xué)相關(guān)性,或在實(shí)驗(yàn)上有競(jìng)爭(zhēng)力”的成果,還有一段路要走。
今年的比賽對(duì)DeepMind來(lái)說(shuō)也并非一帆風(fēng)順。姜普表示,DeepMind在3個(gè)月時(shí)間里毫無(wú)進(jìn)展。“我們坐在那里,擔(dān)心是否已經(jīng)耗盡了數(shù)據(jù)。”即使比賽結(jié)束日期臨近,姜普及其團(tuán)隊(duì)也還在擔(dān)心,他們可能出了錯(cuò)。他說(shuō):“機(jī)器學(xué)習(xí)系統(tǒng)總是會(huì)出各種錯(cuò)誤。”
不過(guò),他們的努力已經(jīng)獲得了回報(bào)。姜普表示:“我們真的認(rèn)為,我們開(kāi)發(fā)了一個(gè)系統(tǒng),為實(shí)驗(yàn)生物學(xué)家提供正確、可操作的信息。你想要尋找這樣的結(jié)構(gòu)是因?yàn)?,你想要去理解大自然,隨后去提出更多的問(wèn)題。我們認(rèn)為,我們開(kāi)發(fā)的系統(tǒng)已經(jīng)可以真正幫助人們?nèi)プ龅竭@一點(diǎn)。”
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