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    智慧育種最強(qiáng)“大腦”!浪潮信息筑牢北大荒墾豐數(shù)據(jù)基座

    “種子不好,豐收難保”,耕地有限的情況下,選擇品質(zhì)更優(yōu)、產(chǎn)量更高的種源成為了保障糧食供應(yīng)的關(guān)鍵手段之一,良種對我國糧食增產(chǎn)的貢獻(xiàn)率超過45%。傳統(tǒng)雜交育種如同中醫(yī)的“望聞問切”,以肉眼觀察作為主要的篩選依據(jù),想要選出優(yōu)質(zhì)的改良品種需要六代的時間,育種周期長、人力和時間成本投入巨大,效果卻難以保證,有時甚至?xí)霈F(xiàn)偽雜交率100%的情況,嚴(yán)重制約了種業(yè)創(chuàng)新和高質(zhì)量發(fā)展。

    作為我國育種領(lǐng)軍企業(yè),北大荒墾豐種業(yè)打造了以商業(yè)化育種為核心的研發(fā)創(chuàng)新體系,為新種研發(fā)提供了詳實(shí)的數(shù)據(jù)支撐,通過國內(nèi)最先進(jìn)的基因檢測設(shè)備對繪制詳細(xì)的種子基因位點(diǎn)地圖,實(shí)現(xiàn)對豐產(chǎn)、抗病等基因的篩選聚合,減少了田間的無效種植,將育種周期從十余年縮短到6-7年。

    數(shù)據(jù)要素加速賦能,育種創(chuàng)新迎新挑戰(zhàn)

    為加快育種創(chuàng)新,種業(yè)正在向生物育種數(shù)智化轉(zhuǎn)型,一方面要推動生物技術(shù)和信息技術(shù)相融合,另一方面育種數(shù)據(jù)規(guī)??焖僭鲩L,帶來一系列計(jì)算和數(shù)據(jù)存儲新問題。搭建能夠滿足生物育種計(jì)算和存儲需求的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施,已成為提高育種效率、降低成本的關(guān)鍵舉措。這對于墾豐種業(yè)的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施提出了新的需求:

    多元數(shù)據(jù)的安全存儲

    為使生物育種更精準(zhǔn)高效,需要通過數(shù)字化技術(shù)對種質(zhì)資源進(jìn)行存儲和保護(hù)。墾豐種業(yè)建有庫存容量可達(dá)40萬份的種質(zhì)資源庫,一期工程共入庫各類種質(zhì)資源9萬余份。就作物基因組數(shù)據(jù)而言,水稻約有5.6萬個基因,玉米約有6萬個基因,小麥約有12萬個基因,不同生長環(huán)境下株型、穗型等表型性狀數(shù)據(jù)則更加多樣和復(fù)雜,且科研工作對數(shù)據(jù)存儲安全性要求較高,需要強(qiáng)大的數(shù)據(jù)存儲底座支撐。

    育種全流程的數(shù)據(jù)融合與協(xié)作共享

    墾豐種業(yè)的商業(yè)化育種平臺要求數(shù)據(jù)能夠跨平臺、跨系統(tǒng)實(shí)時互通、協(xié)作共享。同時育種數(shù)據(jù)呈現(xiàn)多模態(tài)趨勢,包括基因型數(shù)據(jù)、代謝物動態(tài)數(shù)據(jù)以及生產(chǎn)管理數(shù)據(jù)等,這對數(shù)據(jù)的融合管理也提出了挑戰(zhàn)。在育種過程中,育種企業(yè)需要具備數(shù)據(jù)融合的管理應(yīng)用和共享協(xié)作能力,才能提高育種創(chuàng)新效率。

    海量基因數(shù)據(jù)的高效處理和分析能力

    作物基因組的研究分析過程極其復(fù)雜,包括了基因序列比對、基因網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建等,同時科研工作中存在持續(xù)的文件讀寫,涉及大量作物圖片、音視頻片段等小文件,對存儲系統(tǒng)的計(jì)算性能、穩(wěn)定性、小文件處理等能力提出更高要求,這就需要育種企業(yè)具備海量基因數(shù)據(jù)的處理和分析能力。

    極致存儲,助力墾豐破解種子密碼

    在墾豐種業(yè)商業(yè)化育種平臺建設(shè)中,浪潮信息助力打造集中式與分布式相結(jié)合的數(shù)據(jù)存儲底座,以超大容量、多協(xié)議融合、百萬IOPS的領(lǐng)先性能,為墾豐種業(yè)各科研平臺的種質(zhì)基因數(shù)據(jù)存儲、流轉(zhuǎn)協(xié)作與讀寫計(jì)算提供強(qiáng)有力的支撐,新種研發(fā)周期從過去的十幾年縮短到6-7年,推動智慧育種創(chuàng)新突破,為我國農(nóng)業(yè)高效提供優(yōu)質(zhì)新種。

    大容量存儲資源池滿足育種科研存儲和安全需求

    面向墾豐育種科研海量多元的數(shù)據(jù)場景,采用1臺HF5000G5+3臺AS13000G5的高冗余模式存儲系統(tǒng),搭建大容量存儲資源池,充分滿足墾豐種業(yè)的數(shù)據(jù)存儲需求。同時,當(dāng)某節(jié)點(diǎn)故障時會自動切換到備用節(jié)點(diǎn),滿足基因研究數(shù)據(jù)的長時間穩(wěn)定寫入,確??蒲袛?shù)據(jù)安全不丟失,為農(nóng)作物種質(zhì)資源提供了優(yōu)質(zhì)的存儲和保護(hù),提升了育種創(chuàng)新能力。

    多協(xié)議融合存儲滿足育種企業(yè)數(shù)據(jù)管理和創(chuàng)新需求

    針對墾豐種業(yè)基因數(shù)據(jù)、表型數(shù)據(jù)、環(huán)境數(shù)據(jù)等多模態(tài)多尺度數(shù)據(jù)需求,浪潮信息助力搭建先進(jìn)數(shù)據(jù)存儲平臺,實(shí)現(xiàn)一套集群支持塊、文件、對象、大數(shù)據(jù)等協(xié)議數(shù)據(jù)融合互通,為墾豐種業(yè)六大實(shí)驗(yàn)室的研究工作提供更高效便捷的數(shù)據(jù)存儲服務(wù)。同時,墾豐種業(yè)可以利用熱、溫、冷、冰四級數(shù)據(jù)分層策略,實(shí)現(xiàn)對科研數(shù)據(jù)的全生命周期管理,高效滿足多樣化需求,實(shí)現(xiàn)存儲性能、容量和成本的極致平衡,確保高投入產(chǎn)出比。

    百萬IOPS滿足基因測序高通量處理和分析需求

    針對墾豐種業(yè)海量數(shù)據(jù)處理性能需求,浪潮信息為墾豐種業(yè)提供極致的存儲和計(jì)算能力,極大地縮短基因測序的時間。浪潮信息幫助墾豐種業(yè)分層搭建的存儲系統(tǒng),可以自動根據(jù)讀寫頻率實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)智能遷移,并以聚合小文件優(yōu)化技術(shù)提升讀寫性能,容量部署達(dá)11PB,聚合讀帶寬160GB/s以上,寫帶寬100GB/s以上,隨機(jī)讀IOPS達(dá)205萬,滿足墾豐種業(yè)更高的高通量表型組圖像處理需求,最大化提升育種科研計(jì)算效率和育種創(chuàng)新效率。

    現(xiàn)代技術(shù)的發(fā)展改變了傳統(tǒng)育種“一把尺子一桿秤,用牙咬,用眼瞪”的模式,實(shí)現(xiàn)了經(jīng)驗(yàn)育種向精準(zhǔn)育種質(zhì)的飛躍。廣袤大地上滿目金黃,農(nóng)民實(shí)現(xiàn)增產(chǎn)增收,糧食飯碗穩(wěn)穩(wěn)當(dāng)當(dāng),背后是數(shù)據(jù)要素為育種科研強(qiáng)有力的保駕護(hù)航。未來,浪潮信息將進(jìn)一步提供更加高效、便捷的存儲解決方案,洞見數(shù)據(jù)潛能,賦能智慧育種,為農(nóng)業(yè)智慧轉(zhuǎn)型之旅夯實(shí)數(shù)字基座。

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