近年來(lái),人工智能作為一種逐漸發(fā)展和不斷完善的新興技術(shù),被廣泛應(yīng)用到各個(gè)行業(yè)。在關(guān)乎人類生命健康的醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,醫(yī)藥企業(yè)也不斷借助AI突破新藥研發(fā)瓶頸。新藥研發(fā)是技術(shù)含量高、成本投入大、且耗時(shí)最為漫長(zhǎng)的技術(shù)研究領(lǐng)域之ー,一款新藥的研發(fā)周期往往長(zhǎng)達(dá)數(shù)年甚至十余年。藥物研發(fā)作為一種數(shù)據(jù)密集型行業(yè),與AI需要大量數(shù)據(jù)訓(xùn)練的特點(diǎn)相吻合。將AI應(yīng)用于藥物研發(fā),一定程度可優(yōu)化傳統(tǒng)的經(jīng)驗(yàn)型藥物研發(fā)范式,提升新藥研發(fā)效率。
望石智慧(StoneWise),就是率先利用AI驅(qū)動(dòng)新藥研發(fā)的科技公司。公司專注于AI新藥研發(fā)(AIDD)底層理論的開發(fā)和技術(shù)的落地,旨在用技術(shù)與創(chuàng)新力為醫(yī)藥行業(yè)帶來(lái)新視角,打造世界領(lǐng)先的小分子創(chuàng)新藥研發(fā)平臺(tái)。
創(chuàng)新藥的發(fā)現(xiàn)可以類比為“一把鑰匙開一把鎖”,找到與疾病靶點(diǎn)(鎖)最契合的化合物(鑰匙)是藥物研發(fā)的核心之一, 也是望石智慧的主線業(yè)務(wù)之一,即“圍繞HIT(苗頭化合物)發(fā)現(xiàn)為核心的AI小分子藥物整合平臺(tái)”進(jìn)行相關(guān)技術(shù)平臺(tái)的開發(fā),在全球新、臨床導(dǎo)向的項(xiàng)目中,發(fā)現(xiàn)有專利空間的化合物。目前預(yù)估的化學(xué)空間約為10^63,探索潛在成藥化合物的過(guò)程,就如同在浩瀚無(wú)窮的宇宙中,尋找與靶點(diǎn)精準(zhǔn)匹配的鑰匙,工作量難以預(yù)估。借力AI,可以幫助藥物研究工作者快速、準(zhǔn)確地找到符合各類定向需求的鑰匙,但復(fù)雜的算法模型訓(xùn)練和計(jì)算任務(wù)背后需要巨量的算力支撐。
在此場(chǎng)景下,AI制藥公司面臨著硬件采購(gòu)資金投入和運(yùn)維管理壓力較大、且托管與云之間的專線成本高昂等問(wèn)題,網(wǎng)絡(luò)延時(shí)也時(shí)刻制約著業(yè)務(wù)的發(fā)展。且在新藥研究項(xiàng)目的開展過(guò)程中,往往會(huì)在集中時(shí)間段對(duì)算力需求大規(guī)模增加,而在其他時(shí)間出現(xiàn)資源閑置或浪費(fèi)的情況。如何讓算力發(fā)揮最大價(jià)值也是望石智慧面臨的難點(diǎn)之一。
2021年初,在望石智慧底層理論突破、且項(xiàng)目應(yīng)用被大規(guī)模商業(yè)化應(yīng)用之際,中立、安全的云廠商UCloud優(yōu)刻得成為其合作伙伴之一:
>>>使用UCloud快杰云主機(jī)、裸金屬物理云等基礎(chǔ)云資源,將訓(xùn)練負(fù)載遷移到云端,與現(xiàn)有的IT基礎(chǔ)設(shè)施形成混合云架構(gòu)。彈性、靈活的支持大規(guī)模的訓(xùn)練托管部署及推理計(jì)算任務(wù),節(jié)省IT成本投入。同時(shí),由于新藥研發(fā)數(shù)據(jù)處理量龐大,對(duì)服務(wù)器的計(jì)算性能、穩(wěn)定性以及實(shí)時(shí)性等有著苛刻的要求,UCloud優(yōu)刻得裸金屬云正能滿足研發(fā)場(chǎng)景下對(duì)性能的極高要求。
>>>UCloud優(yōu)刻得還為望石智慧提供基于云計(jì)算先進(jìn)經(jīng)驗(yàn)的GPU強(qiáng)大算力支持,在降低成本的同時(shí),獲得可靈活部署、彈性擴(kuò)容的新藥研究訓(xùn)練體驗(yàn);在新藥搜索、推薦、生成等(尤其是基于電子云密度的3D分子生成)高并發(fā)、高吞吐的訓(xùn)練場(chǎng)景下,UCloud優(yōu)刻得高性能文件存儲(chǔ)可充分滿足研究人員平穩(wěn)流暢的數(shù)據(jù)訪問(wèn)體驗(yàn)。
>>>在構(gòu)建全球云計(jì)算中心的部署上,基于多年豐富的云計(jì)算運(yùn)維經(jīng)驗(yàn)和完善的混合云網(wǎng)絡(luò),UCloud優(yōu)刻得為望石智慧打通了現(xiàn)有混合云架構(gòu)下的協(xié)同管理能力,以滿足多元化的業(yè)務(wù)快速發(fā)展。并可與望石智慧公有云產(chǎn)品深度結(jié)合,為用戶提供彈性敏捷、高性價(jià)比的云計(jì)算服務(wù)。
當(dāng)前,在UCloud優(yōu)刻得云平臺(tái)和GPU算力支撐之上,望石智慧實(shí)現(xiàn)了部分底層理論的突破,構(gòu)建了體系化的AI新藥早期研發(fā)系統(tǒng),以及高效實(shí)用的工具平臺(tái)StoneMIND®。
在AI新藥研發(fā)底層理論方面,望石首次提出一整套以大分子實(shí)驗(yàn)電子密度為數(shù)據(jù)基礎(chǔ)的AI新藥研發(fā)底層技術(shù)體系,涵蓋了基于靶點(diǎn)口袋的3D分子生成技術(shù)和基于高精度能量計(jì)算的高效篩選體系。分子生成模型應(yīng)用于多個(gè)以臨床需求為導(dǎo)向的創(chuàng)新小分子藥物開發(fā),充分的利用實(shí)驗(yàn)電子密度中所包含的口袋與配體之間的互補(bǔ)信息,幫助小分子創(chuàng)新藥設(shè)計(jì)人員更加高效的應(yīng)對(duì)“基于靶點(diǎn)口袋結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)小分子”的項(xiàng)目。同時(shí),針對(duì)虛擬庫(kù)+實(shí)體庫(kù)的精準(zhǔn)、高效的篩選,也逐漸落地,幫助小分子創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)人員能夠快速的完成“在廣闊化學(xué)空間基于靶點(diǎn)口袋的快速、精準(zhǔn)的篩選和干濕互動(dòng)”。
StoneMIND® 系列工具中,Collector具有SaaS平臺(tái)、私有化部署、API及桌面端小工具多種形態(tài),能快速高效地從專利、文獻(xiàn)及各類圖片中把化學(xué)結(jié)構(gòu)提取出來(lái),并與并性質(zhì)表格快速關(guān)聯(lián),幫助用戶提高批量處理化學(xué)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)效率、快速搭建自有數(shù)據(jù)庫(kù)。截至目前已服務(wù)用戶10萬(wàn)個(gè)+,一鍵識(shí)別化學(xué)結(jié)構(gòu)式1百萬(wàn)次+,批量提取專利或文獻(xiàn)5萬(wàn)篇+,涵蓋了400+生物醫(yī)藥企業(yè)和科研院所,備受業(yè)內(nèi)認(rèn)可。聚焦在構(gòu)效分析環(huán)節(jié)的Inspirer(SAR可視化分析及輔助決策工具)通過(guò)對(duì)化學(xué)及生物學(xué)數(shù)據(jù)的多維度科學(xué)統(tǒng)計(jì)分析,可以幫助藥研人員更高效地進(jìn)行R基團(tuán)優(yōu)化,從而一站式助力小分子結(jié)構(gòu)修飾和改造。
Collector信息提取體系,秒級(jí)繪制復(fù)雜結(jié)構(gòu)
用科技擴(kuò)展生命的邊界,讓每個(gè)疾病都有藥可醫(yī)。UCloud優(yōu)刻得將與望石智慧深入合作,用穩(wěn)定可靠、靈活彈性的云服務(wù)提供更大算力,支持海量新藥數(shù)據(jù)模型計(jì)算,與望石智慧一起探索更快、更好地藥物研發(fā)新范式的建立。
關(guān)于望石智慧
望石智慧(StoneWise),成立于2018年,是一家致力于通過(guò)人工智能驅(qū)動(dòng)新藥研發(fā)的科技公司。公司旨在用技術(shù)與創(chuàng)新力為醫(yī)藥行業(yè)帶來(lái)新視角,打造世界領(lǐng)先的小分子創(chuàng)新藥研發(fā)平臺(tái)。借助豐富的藥物研發(fā)行業(yè)認(rèn)知、創(chuàng)新的數(shù)據(jù)集成方法和強(qiáng)大的軟件與工程能力,公司搭建了以靶點(diǎn)口袋研究、分子生成、超高通量虛擬篩選、理性設(shè)計(jì)、成藥性優(yōu)化為核心的一體化技術(shù)平臺(tái),用于提升新藥研發(fā)中從苗頭化合物發(fā)現(xiàn)至臨床前候選化合物流程中多個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)的效率與成功率。自成立以來(lái),憑借已被驗(yàn)證的商業(yè)模式、扎實(shí)的技術(shù)根基、綜合的團(tuán)隊(duì),望石智慧已與多家頭部生物醫(yī)藥企業(yè)達(dá)成合作,并獲得了多個(gè)AI和醫(yī)藥領(lǐng)域一線投資機(jī)構(gòu)的認(rèn)可。
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