日前，化學信息學領(lǐng)域國際頂級期刊《Journal of Chemical Information and Modeling》(化學信息與建模)出版了2020年12月新冠特刊，封面為中國古代傳說中神農(nóng)辨藥嘗百草的畫面。該期封面刊出的正是華為云EI醫(yī)療智能體團隊主導(dǎo)的抗疫課題——“神農(nóng)項目”前期成果：新冠病毒藥物虛擬篩選在線交互Web服務(wù)。“神農(nóng)項目”也是迄今為止全球最大的完全免費公開的新冠藥物虛擬篩選數(shù)據(jù)庫。

新型冠狀病毒(COVID-19)的出現(xiàn)在全球范圍影響了人類健康，尋找有效治愈新冠肺炎的治療方式是臨床醫(yī)生和藥物研發(fā)人員最緊迫的工作。計算機輔助藥物篩選根據(jù)病毒靶點和小分子藥物的3D結(jié)構(gòu)，計算病毒蛋白與藥物之間的結(jié)合能量，實現(xiàn)從成千上萬的小分子庫中篩選出與病毒結(jié)合最緊密的候選藥物，從而快速為藥物研究和臨床試驗提供方向。

為了全面、系統(tǒng)地評估藥物對新冠病毒所有靶點蛋白的結(jié)合情況，2020年2月，華為云EI醫(yī)療智能體團隊與華中科技大學同濟醫(yī)學院基礎(chǔ)醫(yī)學院、華中科技大學同濟醫(yī)學院附屬武漢兒童醫(yī)院、西安交通大學第一附屬醫(yī)院、中科院北京基因組研究所迅速成立聯(lián)合團隊，從新冠病毒蛋白序列開始，針對所有21個靶點蛋白進行同源建模、分子動力學模擬優(yōu)化，獲取靶點蛋白的3D結(jié)構(gòu)，對超過8500個已上市、進入臨床的小分子藥物進行了約18萬種藥物-靶點配對情況的計算評估，讓研究人員可以同時從21個蛋白的角度，綜合、無偏地評估藥物效果，從而為后續(xù)的藥物機制研究、臨床試驗提供線索。

“藥物篩選”之旅

華為云EI醫(yī)療智能體平臺基于華為云AI昇騰集群服務(wù)、一站式AI開發(fā)平臺ModelArts，集成了醫(yī)藥領(lǐng)域眾多算法、工具、AI模型和自動化流水線，可以短時間內(nèi)完成上千萬次的模擬計算，讓以往耗時數(shù)月的計算機輔助藥物篩選在數(shù)小時內(nèi)完成。

2020年4月起，“神農(nóng)項目”所有篩選結(jié)果均已陸續(xù)在在線平臺(https://shennongproject.ai/)公開，藥物研發(fā)人員可在多個終端瀏覽器查看靶蛋白和藥物的3D結(jié)合結(jié)構(gòu)以及計算評分，無需安裝任何專業(yè)的結(jié)構(gòu)生物學軟件。

“神農(nóng)項目”發(fā)表的公開數(shù)據(jù)得到了中外廣泛的關(guān)注，同時也收到了大量的咨詢郵件。該數(shù)據(jù)平臺為多款臨床正在使用、臨床測試的中西藥的分子作用機理提供了理論基礎(chǔ)。

（免責聲明：本網(wǎng)站內(nèi)容主要來自原創(chuàng)、合作伙伴供稿和第三方自媒體作者投稿，凡在本網(wǎng)站出現(xiàn)的信息，均僅供參考。本網(wǎng)站將盡力確保所提供信息的準確性及可靠性，但不保證有關(guān)資料的準確性及可靠性，讀者在使用前請進一步核實，并對任何自主決定的行為負責。本網(wǎng)站對有關(guān)資料所引致的錯誤、不確或遺漏，概不負任何法律責任。
任何單位或個人認為本網(wǎng)站中的網(wǎng)頁或鏈接內(nèi)容可能涉嫌侵犯其知識產(chǎn)權(quán)或存在不實內(nèi)容時，應(yīng)及時向本網(wǎng)站提出書面權(quán)利通知或不實情況說明，并提供身份證明、權(quán)屬證明及詳細侵權(quán)或不實情況證明。本網(wǎng)站在收到上述法律文件后，將會依法盡快聯(lián)系相關(guān)文章源頭核實，溝通刪除相關(guān)內(nèi)容或斷開相關(guān)鏈接。 ）