9月27日,阿里云在上海國(guó)際生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)周同期活動(dòng)上透露,其飛天智算平臺(tái)上的生命科學(xué)與生物醫(yī)藥用戶(hù)已超過(guò)200家,為基因及其他組學(xué)分析、創(chuàng)新藥物研發(fā)、藥物臨床數(shù)據(jù)分析等生命科學(xué)服務(wù)提供了智能算力。
“我們?cè)诤涂蒲袡C(jī)構(gòu)、產(chǎn)業(yè)的深度合作中發(fā)現(xiàn),生命科學(xué)服務(wù)需要更高效、更智能、更綠色的算力,來(lái)提高生物信息及臨床數(shù)據(jù)利用的效率,加速藥物研發(fā)過(guò)程。”阿里云智能中國(guó)區(qū)副總裁韓飛在當(dāng)天的飛天智算·生物醫(yī)藥高峰論壇上表示。
近年來(lái),以機(jī)器學(xué)習(xí)、尤其是深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)為代表的AI技術(shù)發(fā)展,為生命科學(xué)在生物計(jì)算、人工智能藥物設(shè)計(jì)等方向帶來(lái)了新的技術(shù)理念與突破。
以個(gè)性化藥物用藥為例,上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院院長(zhǎng)聘教授魏冬青指出,通過(guò)將AI藥物發(fā)現(xiàn)技術(shù)整合到計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)軟件,把深度學(xué)習(xí)等非線(xiàn)性方法應(yīng)用到藥物構(gòu)效關(guān)系、藥物代謝以及毒理和基因表型相關(guān)性的研究中,對(duì)個(gè)性化藥物用藥有一定的指導(dǎo)意義。
隨之而來(lái)的是生命科學(xué)數(shù)據(jù)的大爆發(fā),傳統(tǒng)研究方法在現(xiàn)有算力條件下面臨計(jì)算成本過(guò)高、效率過(guò)低的問(wèn)題。由此,智能計(jì)算成為突破藥物設(shè)計(jì)中分子蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或功能預(yù)測(cè)、藥物親和力分析、成藥性評(píng)估等關(guān)鍵難點(diǎn)問(wèn)題的有力武器。
今年8月阿里云正式發(fā)布飛天智算平臺(tái),以算力和大數(shù)據(jù)AI一體化的解決方案服務(wù)于生物醫(yī)藥等算力高需求行業(yè),其用戶(hù)深勢(shì)科技與阿里云合作定向優(yōu)化其分子動(dòng)力學(xué)仿真模擬模型,訓(xùn)練效率提升了5倍;北大化學(xué)與分子工程學(xué)院進(jìn)行靶向藥物研究的數(shù)據(jù)集構(gòu)建效率提升了100倍。
國(guó)際知名藥企羅氏在藥物早研業(yè)務(wù)中也引入了智能計(jì)算。藥物早研不僅涉及人工智能、機(jī)器學(xué)習(xí),還需要在前期做數(shù)據(jù)準(zhǔn)備,并在模型訓(xùn)練完成后進(jìn)行部署,完成模型推理和模型調(diào)優(yōu)。“在飛天智算平臺(tái)上,科學(xué)家可以更專(zhuān)注在模型本身的持續(xù)優(yōu)化,而不用去考慮算力資源和運(yùn)維問(wèn)題。”羅氏高級(jí)解決方案架構(gòu)師張弛說(shuō)。
國(guó)內(nèi)領(lǐng)先基因測(cè)序企業(yè)序禎達(dá)聯(lián)合創(chuàng)始人兼CIO費(fèi)家俊在談及與阿里云合作時(shí)則表示:“運(yùn)用阿里云的基因計(jì)算平臺(tái),序禎達(dá)生物在云端搭建起了全流程生產(chǎn)管理和數(shù)據(jù)處理系統(tǒng),將實(shí)驗(yàn)室積累的知識(shí)和經(jīng)驗(yàn)轉(zhuǎn)化到云端,極大提升了生產(chǎn)效率,減少了前期投入?!?/p>
韓飛表示,未來(lái)阿里云在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的投入將圍繞三個(gè)方面展開(kāi):一是與浙江大學(xué)、中山大學(xué)、GHDDI等科研機(jī)構(gòu)的合作,未來(lái)還會(huì)繼續(xù)加強(qiáng);二是借助阿里云智能計(jì)算、隱私安全計(jì)算和藥企安全合規(guī)等技術(shù)能力,推動(dòng)技術(shù)與產(chǎn)業(yè)的融合,提高生物醫(yī)藥企業(yè)的研發(fā)效率;三是聯(lián)合伙伴打造產(chǎn)業(yè)生態(tài),與相關(guān)部門(mén)共同推動(dòng)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)。
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