全球新冠讓我們看到了這些疫情是多么可怕,而且情況可能更糟?,F(xiàn)在,科學(xué)家們開發(fā)了一種AI應(yīng)用程序,可以警告我們未來疫情中可能出現(xiàn)的危險變種。
該系統(tǒng)被稱為早期預(yù)警異常檢測系統(tǒng)(EWAD),在測試了新冠病毒傳播的實際數(shù)據(jù)后,它能夠準(zhǔn)確預(yù)測哪些新的變異體(VOC)會隨著病毒突變而出現(xiàn)。
美國斯克里普斯研究中心和西北大學(xué)的科學(xué)家們使用機器學(xué)習(xí)方法來開發(fā) EWAD。在機器學(xué)習(xí)中,計算機會分析大量的訓(xùn)練數(shù)據(jù)來發(fā)現(xiàn)模式,開發(fā)算法,然后預(yù)測這些模式在未來未知的場景中可能如何發(fā)揮作用。
在本例中,AI被提供有關(guān)新冠病毒變種的遺傳序列的信息,以及這些變種的頻率和新冠的全球死亡率報告。該軟件可以檢測到病毒適應(yīng)時發(fā)生的遺傳變化,通常表現(xiàn)為感染率增加和死亡率下降。
“我們可以看到關(guān)鍵的基因變體出現(xiàn)并變得更普遍,死亡率也發(fā)生了變化,所有這些都發(fā)生在 WHO 正式指定包含這些變體的之前幾周,”研究中心的微生物學(xué)家 William Balch 說。
AI能夠提前發(fā)現(xiàn)所關(guān)注的變種
該團隊在這里使用的方法被稱為基于高斯過程的空間協(xié)方差,它本質(zhì)上是將現(xiàn)有數(shù)據(jù)集的數(shù)字進行處理來預(yù)測新數(shù)據(jù),使用不僅僅是數(shù)據(jù)點的平均值,還使用它們之間的關(guān)系。
通過在已經(jīng)發(fā)生的事情上測試他們的模型并在真實數(shù)據(jù)和預(yù)測數(shù)據(jù)之間找到接近的匹配,科學(xué)家們可以證明 EWAD 在預(yù)測疫苗和戴口罩等措施如何導(dǎo)致病毒繼續(xù)進化方面的有效性。
“這項工作的一個重要教訓(xùn)是,不僅要考慮少數(shù)突出變體,還要考慮數(shù)萬個其他未指定變體,我們稱之為“變異暗物質(zhì)”。 Balch 說。研究人員表示,他們的AI算法能夠發(fā)現(xiàn)原本會被忽視的病毒進化“規(guī)則”,這在應(yīng)對未來疫情的出現(xiàn)時可能至關(guān)重要。
不僅如此,在這里開發(fā)的系統(tǒng)還可以讓科學(xué)家們更好地理解病毒生物學(xué)的基礎(chǔ)。這可以然后用于改進治療方法和其他公共衛(wèi)生措施。
本文譯自 ScienceAlert,由 BALI 編輯發(fā)布。
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